岐阜大学教育学部附属郷土博物館植物標本庫の所蔵する植物標本のコレクションは、主として岐阜県とその近隣で採集された『岐阜県植物誌』の証拠標本、希少種・固有種を数多く含み県レッドリストの策定に大きく係る標本群、植物相の研究に引用されている標本群等で構成されている。
また、標本関連資料として、各地の植物誌・植生（フロラ）、分類学（モノグラフ）の文献、植物図鑑、岐阜県植物研究会・植物誌調査会関連文献等が前室に配置され、標本庫利用者に供されている。
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